Nato a Palermo nel 1955, Alberto Burgio si è laureato in Lettere Moderne a Pavia nel 1978 e in Filosofia alla Statale di Milano nel 1983.
Nel 1989 è entrato nei ruoli dell'Università in qualità di ricercatore in Storia della Filosofia presso la Facoltà di Magistero di Urbino.
Nel 1993 ha vinto il concorso di professore associato presso il Dipartimento di Filosofia dell'Università di Bologna dove, successivamente, è diventato professore ordinario di Storia della filosofia nell'anno accademico 2001-2002.
Dall'a.a. 2005-06 tiene l'insegnamento di «Immagini della razza nella letteratura scientifica» quale professore a contratto nell'ambito della Laurea Specialistica in Scienze dello spettacolo e della produzione multimediale presso la Facoltà di Scienze della Formazione dell'Università “Suor Orsola Benincasa” di Napoli.
Iscritto al Partito della Rifondazione Comunista dalla nascita del partito, è membro del Comitato Politico Nazionale (dal 1991) e della Direzione Nazionale (dal 2005). Ha ricoperto gli incarichi di Responsabile Giustizia (dal 2002 al 2005) e di Responsabile del Comitato Scientifico (dal 2008). È stato eletto deputato al Parlamento della Repubblica dopo le elezioni politiche del 2006 (XV legislatura ).
È condirettore di «Marxismo oggi»; membro del comitato di direzione della rivista «Dianoia. Annali di storia della filosofia del Dipartimento di Filosofia dell'Università di Bologna»; membro dei comitati editoriali di «Studi settecenteschi», «Rivista sperimentale di freniatria», «Studi sulla questione criminale», «Critica marxista»; «Psicoterapia e scienze umane».
Nel 2004 è Presidente del Corso di Laurea in Filosofia dell'Università degli Studi di Bologna. Dal 2009 è Direttore del Dipartimento di Filosofia dell'Università di Bologna.